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PHPのソースを分析するフリーなツールってありませんかね？
先ずは関数/クラスのツリーがテキスト形式で出力できればいいんですけど、
なかなか見つかりません（表示だけじゃなくて残したい）。
CやC++やJavaのなら結構ありそうなんですけど。
ダメもとでC++用の使ってみたけど、案の定ダメでしたｗ
どなたかご存じありませんか？よろしくお願いします。

<a href="http://phpspot.net/php/pgphpDocumentor.html">phpDocumentor</a>はだめですか？

失礼。

http://phpspot.net/php/pgphpDocumentor.htmlはだめですか？

アドバイスありがとうございます。
早速 phpDocumentor を試してみました。
ソースコードのマニュアルを作るには便利そうですね。
ただ、これだと全てのコメントをつけ直さないといけないのと
（PHPDoc形式では書いていませんでした。。。）
ファイルの中にある定義の説明は分かりますが、
その定義がどこから呼ばれているか？（どこのソースに影響があるか？）
は、分かりませんね。。。
Vectorで探すと C/C++/Java/VB/Delphi用には
EPTREE というツールを公開してくださっている方がいらっしゃるのですが、
これをPHPには流用は出来ませんでした(^^;